Основные направления деятельности ЦНИЛхлебопродукт:

• проведение испытаний показателей качества и безопасности продукции растениеводства, кормов, кормовых добавок, мукомольно-крупяной продукции, продуктов пищевых, минерального сырья, химических веществ;
• подтверждение соответствия продукции растениеводства, мукомольно-крупяной продукции, кормов, кормовых добавок, пищевых продуктов, минерального сырья, химических веществ требованиям технических нормативных правовых актов;
• научно-исследовательская деятельность по разработке методик выполнения измерений и методик оценивания неопределенности измерений, валидации и верификации химических, физико-химических и микробиологических методов исследований;
• информационная поддержка в области исследований и разработок методик;
• разработка и ведение информационного справочника «Классификатор  сырья и продукции комбикормовой промышленности».